高通量测序 锁定病原体“命门”
来源:马军蒋火网    发布日期:2019-09-10 19:22:56

预判威胁防患SARS“东山再起”

印度尼西亚南部地区发生5.1级地震。(图片来源:美国地质勘探局网站截图)

而永远不许开花的种子

为此,研究团队设计开发了埃博拉病毒基因组的新测序策略——扩增子深度测序技术,并开发了一套全新的生物信息学分析流程。“我们设计了标准质粒进行方法验证,将测序方法的假阳性率控制在千分之一以下。”刘翟介绍,考虑到在宿主中病毒的痕量,团队还在方法的敏感性上取得了突破,做到低浓度样本下仍能探测到位点变化。

Bartosz Biskupski博士介绍欧洲研发中心基本情况

《变形金刚》里的威震天被消灭多次,却会在宇宙的尽头休整,一旦人们放松就伺机重生。SARS冠状病毒在2003年造成了全球性的恐慌之后,会不会上演威震天的戏码?

图为农事体验活动。 晏华 摄

在政策方面,从《国家中长期教育改革和发展规划纲要(2010-2020年)》、《国家教育事业发展“十三五”规划》到《普通高中课程方案和语文等学科课程标准(2017版)》、《高等学校人工智能创新行动计划》,积极推动教育信息化进程。

病原体能使人类群体性致病甚至致死,为追本溯源,找到变异基因作为有效靶点,科学家们在迎战埃博拉病毒的过程中取得突破。

《科学》杂志的历史上,刊载过一篇沉重的学术文章。2014年一篇关于通过基因组学手段监测埃博拉病毒的起源和传播的论文,在刊登时已有6名研究人员因感染埃博拉而死亡。

“A股整体投资风格越来越偏向于成熟的价值投资,但分化将是今后A股的主线。中小创内部同样会出现巨大分化,中小创版的‘漂亮50’会获得资金青睐。仅依靠概念和炒作的中小创个股没有太多希望,它们藏‘雷’太多,机构资金是敬而远之的。”刘成说。

节目每期为观众展现有同一固定主题的两堂课,2位跨界老师则需要在固定主题中选出自己所要教授的经典课文,或是名家美文,或是诗词歌赋。同一时空,两个课堂交叉对话,不同的讲述风格,也将为观众带来“有温度,有湿度”的体验。

他认为,目前,上海两大机场已经很好地服务于长江以南地区,因此,“第三机场”应首先考虑相对薄弱的长江以北地区。

70年前,新中国编年史翻开崭新一页,中国共产党带领中国人民结束战乱频发、山河破碎、民不聊生的深重苦难,建立中华人民共和国,谱写了气吞山河的壮丽史诗。

至于对汇率的影响,杨德龙认为,不会对人民币形成贬值压力。“本次降准弥补了银行体系流动性缺口,优化了流动性结构,银根并没有放松,市场利率是稳定的,广义货币(M2)和社会融资规模增长率与名义GDP增长率基本匹配,是合理适度的。”

将章莹颖绑架致死;

除了进攻路线,团队还揭示了埃博拉病毒基于自身的“战术变化”——在宿主内,埃博拉病毒曾经产生了710个单核苷酸变异位点,也维持着最保守基因的不变。保守基因的发现相当于抓到了病毒的“七寸”。刘翟逆向思维,“最保守基因的突变对于病毒大都有害,可以作为最有效的抗病毒靶点。”

为了回答新发现病毒与SARS病毒同源性如何、如何传播、感染人类能力等问题,多个科研机构组成的团队共同展开研究,基于二代测序技术进行病毒分离鉴定、动物感染回归实验、回顾性检测等工作。团队将新病毒命名为猪急性腹泻综合征(SADS)冠状病毒。

仪式上,洛浦县委书记王玉军、中建集团副总经理,产融发展中心总经理宫志斌分别致辞,表达庆贺与期望。随后,双方代表共同培土奠基。洛浦县相关部门及乡镇村干部代表、园区企业职工代表计700余人到场,一起见证项目正式开工。

随后,科研团队用已确定的病毒特征为“钓饵”,在广东地区近几年收集的蝙蝠标本中,寻找是否有蝙蝠携带关联病毒。在几百个样本中,团队获得了58份结果为阳性的样本,大部分来自中华菊头蝠(注:科学家们此前证实SARS病毒正是来源于中华菊头蝠)。团队进行了病毒传播路线图的绘制,发现发病的4个猪场并没有相互传染,很有可能是通过蝙蝠的粪便传播。

国际举联今年重新设立级别,给男子67公斤级设置的世界纪录分别是抓举153公斤、挺举184公斤,总成绩331公斤。男子67公斤级,谌利军和黄闽豪都展现竞争力。抓举黄闽豪以152公斤获得冠军,谌利军以150公斤获得亚军。

特朗普(图源:东方IC)

一零一中温泉校区执行校长于晓冰曾说,“我们希望教育出来活泼的人,他们都有怒放的生命。这需要尊重与爱。一零一中温泉校区关注每一个独特生命。” 学校积极开发丰富的课程满足每个学生的需求,目前已开发人文类、科技类等校本课程18门。将“当代知名书画家走进温泉校区”“北京一零一中教育集团首届书写大会”等传统文化活动课程化、系列化。开展《智能驾驶》《南极海冰》等课程,培养学生的创新思维。依托总校与中国科学院合作,实施了“云南科考”、“广西科考”等课程,目前,正与国家海洋局等单位合作实施“北极科考”“美国太空夏令营”“青岛海洋科考”等课程。三年来,一零一中温泉校区已实施学农实践活动周、黄花城水长城考察等20多次综合实践活动课。还曾邀请著名经济学家厉以宁、诺贝尔文学奖获得者莫言等名人走进一零一,并以名师课程激发创新思维。此外,学校就指导学生组建了15个社团,注重以社团课程促进学生个性发展。

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“我这样的人,到哪里不被人嫌弃?”只有在这里,才有人毫无负担地称呼你“兄弟”。

团队对于样本的生物信息学分析,在病毒暴发过程中第一次锁定了埃博拉病毒的“进攻线路图”。刘翟展示的病毒地理学联络图,显示与西非的城市热度和交通枢纽相一致。

初入临床颠覆对罕见菌致病性认识

在2014西非埃博拉病毒爆发期间,美国的团队最初断言病毒可能在加速进化。刘翟回忆,这一发现在当时是一个“面临强敌”的信号,它意味着传统的检测防治方法或许失效,如果埃博拉病毒是迅速变化且致命性叠加的致病原,其危险性将比人类最初认知的更高。

中国工程院副院长、中国医学科学院、北京协和医学院院校长王辰院士呼吁:感染性(传染性)疾病危害严重,精准诊断是实现其精准防控的前提。针对感染这一重大医学问题,需要将基因检测与传统检测相结合,加快将最新的生物科技转化成先进生产力,应用于临床感染精准诊疗。(记者张佳星)

胡必杰认为,现实与教科书中的反差是由于此前的手段难以帮助医生诊断出这种致病菌。“它非常细小,在同样的培养条件下,很难被分离出来,而且需要7天才会培养到可见。普通培养一般3天。”胡必杰说,菌体的“个性”使得凭经验在病例中发现它相对困难。

“近一年仅我们团队在诊断病历中就发现8例诺卡氏菌病例。而在教科书中,这类菌被描述为罕见菌。”复旦大学附属中山医院感染病科主任胡必杰教授说,过往资料表明,人类对这种菌的致病性认识非常有限。

几年前,广东省四个猪场出现了小猪仔急性腹泻死亡的疫情,两万多头小猪出生后6天之内迅速死亡。这引起了军事医学科学院研究员童贻刚的注意,“近年来发生的重大传染病疫情大部分由动物病毒跨种传播引起,此次疫情发生地距离SARS发源地小于100公里。我们通过遗传物质的测序确定致病病毒也是一类冠状病毒。”病毒类型、发生地点以及近年规律都不同程度地亮起“警报”。

二代测序技术让它们重新回到医生的诊断“视野”。胡必杰表示,通过对宏基因组进行测序,可无差别地检测各种病原体,突破了传统检测手段的限制,大大提高了病原学检出的敏感性,这种之前难以被检出的病原体也“露了馅”。24小时内诊断也能为急性感染的判断和对症迅速给出参考。

同类技术在SARS(严重急性呼吸综合征)同族病毒的发现与监控中,也发挥了居功至伟的作用。

因为贸易问题,特朗普和法国总统马克龙也是吵得不可开交。

这件事至少有两个方面的教训值得吸取。一,做好人好事,特别是这种带有长期性、具有较大经济关联的帮扶合作,不能全依赖道德热情的驱使,还是得靠明确的规则驱动。同时,也不能因为是做好事,帮扶的一方就想当然的认为自己可以随时撂挑子,即便不能“帮到底”,也该负责任的善后。这不是道德绑架,而是现代公益或慈善的基本要求。二,若仅仅因为动物园换了领导就导致合作被中止,这除了说明,依靠口头协议、缺乏责任条款的合作具有相当的脆弱性,也未必不是“新官不理旧账”之风盛行的又一个注脚。

“我们对猪场的饲养员进行了病原体检测,没有发现人员感染。”童贻刚说,但是对于病毒组学的研究表明,该类病毒是有能力感染人类的。病毒对人体的作用,以及激发人体内的免疫反应和对病毒表达的调控,仍是一个严峻课题,有待探索。

由于设备要求高、技术门槛高、平台构建需要大量资金投入,目前在临床应用领域,二代测序只是“初入”,只有条件好、资金充足的少量三甲医院在建相关平台、培养和储备技术人员。此外,不同样本的提取如何才能高效准确、遗传物质的提取质量标准如何,都尚待完善。中国食品药品检定研究院的双盲测试表明,对于同样的已知基因,不同测序公司的结果也并非完全一致。

二代测序的应用不是简单地将病例样本中的基因提取出来进行比对。全基因组的遗传信息繁杂而海量,测定不只包括量的叠加,还包括相互作用和影响,即测定病毒在宿主体内的进化,以体现宿主和病毒的基因组之间的相互作用与关联。宏基因组学的研究基础是人和病毒的遗传物质混在“一个篮子里”,这增加了研究工作难度;此外,由于埃博拉病毒是RNA病毒,共同提取的将是人类遗传物质中的RNA,RNA的复杂程度也加大了研究难度……

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“病毒在短时间内迅速变化并不符合进化逻辑。”刘翟说,要改变美国团队的结论,中国团队需要提供更多的事实和数据。

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“对埃博拉病毒的研究和控制是高通量测序技术(二代测序技术)全面应用的首次‘实战’。”日前,在由中国医学科学院、北京协和医学院主办的第二届感染性疾病精准医学高峰论坛上,参加过与埃博拉病毒一线作战的研究人员,对中国团队与埃博拉病毒“作战”的战略战术进行了揭秘。中国科学院武汉病毒研究所研究员刘翟表示,病原体能使人类群体性致病甚至致死,二代测序技术及宏基因组学能帮助人类追溯病原体、捕捉放大它们在分子水平上的变化、锁定病原体“命门”,最终赢得“人毒之战”“人菌之战”。

除了在威胁全球的重大传染病疫情的防控中发挥重要作用,二代测序技术在日常临床中的应用将有助于“认新”“控药”“测毒”等,即诊断新型病原体、确定病毒的抗药性以防止抗生素滥用、测定不同流行病的源头等。

“通过新旧病毒的比对,我们发现它与SARS病毒在外壳蛋白上有86%的相似度。”童贻刚说,这说明感染蛋白可能发生了变化。也就是说,病毒获准进入机体完成感染的“敲门砖”变了。

中国团队在非期间检测了大量临床样本,对175株埃博拉病毒进行了全基因组测序。“利用二代测序技术,很少的变异也能被‘觉察’到。”刘翟说。

蔡冠深说,改革开放前,内地有一个说法是“做也三十六,不做也三十六”。也就是说不论是否努力工作,收入都是不变的。人们缺乏工作的积极性,也就很难富裕起来。“当时渔民用的,只是最简陋的木船,衣服也只有灰、绿、蓝三种颜色,和今天相比可以说是天壤之别。”

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